阴茎上长小肉疙瘩菜花状，可能是尖锐湿疣、珍珠状阴茎丘疹、皮脂腺囊肿、毛囊炎等疾病导致。建议患者及时就医，在医生的指导下进行治疗。
1、尖锐湿疣：多是由于不洁性生活或存在多个性伴侣，导致人乳头瘤病毒感染所引起，可出现菜花状赘生物，伴有瘙痒、疼痛等症状。可在医生的指导下使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物进行治疗；
2、珍珠状阴茎丘疹：可能与包皮过长有关，会导致龟头部位出现珍珠样丘疹，表现为淡红色的小颗粒，表面光滑，质地较硬。一般不需要特殊治疗，如果影响美观，也可遵医嘱通过激光手术的方式去除；
3、皮脂腺囊肿：通常是由于局部卫生清洁不当或长期熬夜等原因导致，可使阴茎部位出现皮脂腺囊肿，并且会呈现为菜花状的肉疙瘩。若没有其他不适症状，通常不需要特殊处理。如果出现红肿、疼痛等症状，则需要在医生的指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟片等药物进行治疗；
4、毛囊炎：通常是由于细菌感染所引起，会导致阴茎部位出现以毛囊为中心的红色丘疹，并且会伴随瘙痒以及疼痛的症状。可以遵医嘱外用夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏等药物进行治疗。
还可能是尖锐湿疣、生殖器疱疹等疾病所致。日常生活中应注意个人卫生，勤换洗内裤，并注意保持私处清洁干燥。
